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    Vincenzo NIGRO

    Insegnamento di Genetica Medica 1

    Corso di laurea magistrale a ciclo unico in MEDICINA E CHIRURGIA (Sede di Napoli)

    SSD: MED/03

    CFU: 2,00

    ORE PER UNITÀ DIDATTICA: 20,00

    Periodo di Erogazione: Secondo Semestre

    Italiano

    Lingua di insegnamento

    Italiano

    Contenuti

    I principi generali della genetica medica e della genetica molecolare
    umana

    Testi di riferimento

    Materiali didattici disponibili a lezione sotto forma di files elettronici
    Capitoli ed argomenti selezionati da testi internazionali e reviews in
    inglese.
    Per consultazioni in italiano i testi più accreditati, ma meno aggiornati
    sono:
    • Genetica umana e medica-Neri-Genuardi- Masson.
    • Genetica in Medicina.-Nussbaum - McInnes – Willard. THOMPSON &
    THOMPSON -Idelson-Gnocchi.
    • Genetica molecolare umana. Strachan-Read. Zanichelli.

    Obiettivi formativi

    Al termine del corso, lo studente avrà acquisito una preparazione di base
    che gli consentirà di comprendere i principi che governano la
    trasmissione delle malattie mendeliane, l’interpretazione dei test genetici
    e il loro uso in consulenza prenatale e postnatale. Inoltre avrà le
    conoscenze adeguate per riconoscere le principali malattie genetiche e
    sindromi complesse.

    Prerequisiti

    Conoscenze di biologia, di genetica, di biochimica

    Metodologie didattiche

    Lezioni frontali e lavoro interattivo con gli studenti su questioni aperte.
    Lavoro a piccoli gruppi.
    Le tematiche di genetica clinica saranno corredate con presentazioni di
    casi clinici, in immagini e video

    Metodi di valutazione

    La prova d’esame sarà sostenuta contestualmente alle prove
    dell’insegnamento di Patologia e Fisiopatologia Generale alla fine del I
    semestre del III anno. Il non superamento dell’esame di Genetica medica
    non consentirà lo svolgimento dell’esame di Patologia e Fisiopatologia
    Generale e viceversa.
    L’esame orale è basato su tre domande. Sarà richiesta la conoscenza
    adeguata di una malattia genetica trattata a lezione, dei test diagnostici
    molecolari a supporto e di un meccanismo/ragionamento di genetica
    medica volto a dimostrare la comprensione dei percorsi logici. Risposte
    non date, fuori tema o generiche saranno considerate elementi di non
    sufficienza. La lode sarà proposta collegialmente per gli studenti che
    dimostreranno una conoscenza oltre quella richiesta dal corso.

    Altre informazioni

    La frequenza a lezione è obbligatoria in presenza

    Programma del corso

    1. Il genoma
    Il genoma umano: geni ed organizzazione. Cromatidi e cromosomi:
    telomeri, centromeri, eucromatina ed eterocromatina. Il cromosoma X e
    la sua inattivazione, regioni PAR. La funzioni degli RNA codificanti e non
    codificanti. Lo splicing.
    2. I test genetici.
    L'analisi del cariotipo e i bandeggi, la FISH. arrayCGH. PCR,
    sequenziamento, real-time PCR, MLPA. Analisi di linkage, microsatelliti,
    CNV ed SNPs. Next generation sequencing (NGS), WGS, exoma, targeted
    NGS. Noninvasive Prenatal Testing (NIPT)
    3. I meccanismi della genetica umana
    I meccanismi di trasmissione ereditaria dei caratteri mendeliani. Eredità
    mitocondriale. L’imprinting e la disomia uniparentale. Eterogeneità clinica
    ed eterogeneità genetica. Penetranza ed espressività, anticipazione.
    Omozigosità ed eterozigosità composta. Aploinsufficienza.
    4. Patologia cromosomica
    La consulenza genetica: rischio riproduttivo dipendente ed indipendente
    dal partner. Aneuploidie negli aborti e rischio di ricorrenza. Triploidia da
    doppio corredo paterno o materno, tetraploidia. Trisomie autosomiche
    (21, 18, 13, 16) e dei cromosomi sessuali. Mosaicismo. Le monosomie, la
    sindrome di Turner
    5. Patologia subcromosomica
    Delezioni cromosomiche, inversioni paracentriche e pericentriche.
    Traslocazioni sbilanciate e bilanciate, robertsoniane, markers
    cromosomici. Delezioni e duplicazioni submicroscopiche (Williams, di
    diGeorge, Cri du Chat, Smith Magenis, Wolf Hirschhorn)
    6. Patologia genetica mendeliana
    Classi di mutazioni puntiformi, transizione e trasversione, conservative,
    missenso, nonsenso, nonstop. Inserzioni, delezioni con frame-shift e non,
    duplicazioni, conversione genica.Significato patologico delle varie classi
    di variazioni del DNA: alleli equivalente, amorfo, ipomorfo, ipermorfo,
    neomorfo e antimorfo. Nomenclatura internazionale delle variazioni
    genetiche
    7. Malattie mendeliane monoalleliche con mutazioni de novo
    (es: craniosonostosi, acondroplasia, sindrome di Noonan, sindrome di Rubenstein-Taybi, ecc).
    8. Malattie mendeliane monoalleliche a trasmissione autosomica
    dominante
    (es. neurofibromatosi, s. di Marfan, rene policistico, osteogenesi
    imperfetta).
    9. Malattie mendeliane monoalleliche legate al cromosoma X
    (distrofia muscolare di Duchenne e Becker, emofilia, sindrome di Rett).
    10. Malattie mendeliane bialleliche a trasmissione autosomica recessiva
    (fibrosi cistica, alfa e beta talassemia, amiotrofia spinale, emocromatosi,
    glicogenosi, distrofie muscolari dei cingoli)
    11. Mutazioni dinamiche
    Mutazioni dinamiche in regioni non codificanti (X-fragile, distrofia
    miotonica). Mutazioni dinamiche in regioni codificanti (corea di
    Huntington, atassie spino-cerebellari)
    12. Mutazioni in regioni cromosomiche con imprinting
    (Prader-Willi, Beckwith Wiedemann, Angelman, Silver-Russel).
    13. Mutazioni del DNA mitocondriale
    (MERFF, MELAS, LHON, KS, s. di Leigh)
    14. Caratteri multifattoriali e studi GWAs

    English

    Teaching language

    Italian

    Contents

    The general principles of medical genetics and human molecular genetics

    Textbook and course materials

    Teaching materials available in class in the form of electronic files
    Chapters and topics selected from international texts and reviews in
    English.
    For consultations the most accreditedtexts are:
    • Genetica umana e medica - Neri-Genuardi- Masson.
    • Genetics in Medicine.-Nussbaum - McInnes - Willard. THOMPSON &
    THOMPSON -
    • Human molecular genetics. Strachan-Read.

    Course objectives

    At the end of the course, the student will have acquired a basic
    preparation that will allow him to understand the principles that govern
    the transmission of Mendelian diseases, the interpretation of genetic
    tests and their use in prenatal and postnatal counseling. It will also have
    the appropriate knowledge to recognize the main genetic diseases and
    complex syndromes.

    Prerequisites

    Knowledge of biology, genetics, biochemistry

    Teaching methods

    Lectures and interactive work with students on open issues. Work in small
    groups.
    The topics of clinical genetics will be accompanied by presentations of
    clinical cases, in images and videos

    Evaluation methods

    The exam will be taken at the end of the first semester of the III year.
    Failure to pass the Medical Genetics exam will not allow the General
    Pathology and Physiopathology examination to take place and vice versa.
    The oral exam is based on three questions. Appropriate knowledge of a
    genetic disease treated in class, of supporting molecular diagnostic tests
    and of a mechanism / reasoning of medical genetics will be required to
    demonstrate the understanding of logical pathways. Answers not given,
    off topic or generic knowledge will be considered as elements of
    insufficiency. The praise will be proposed collegially for students who will
    demonstrate a knowledge beyond that required by the course.

    Other information

    Class attendance is mandatory by law

    Course Syllabus

    1. The genome
    The human genome: genes and organization. Chromatids and
    chromosomes: telomeres, centromers, euchromatin and
    heterochromatin. The X chromosome and its inactivation, PAR regions.
    The function of coding and non-coding RNAs. Splicing.
    2. Genetic tests.
    The analysis of the karyotype and the bandages, the FISH. arrayCGH.
    PCR, sequencing, real-time PCR, MLPA. Linkage analysis, microsatellites,
    CNV and SNPs. Next generation sequencing (NGS), WGS, exome,
    targeted NGS. Noninvasive Prenatal Testing (NIPT)
    3. The mechanisms of human genetics
    The hereditary transmission mechanisms of Mendelian characters. Mitochondrial inheritance. Imprinting and uniparental disomy. Clinical
    heterogeneity and genetic heterogeneity. Penetrance and expressivity,
    anticipation. Homozygosity and compound heterozygosity.
    Haploinsufficiency.
    4. Chromosomal pathology
    Genetic counseling: reproductive risk dependent and independent of the
    partner. Aneuploidy in abortions and risk of recurrence. Triploidy from a
    paternal or maternal double, tetraploidy. Autosomal trisomies (21, 18, 13,
    16) and sex chromosomes. Mosaicism. Monosomies, Turner's syndrome
    5. Sub-chromosomal pathology
    Chromosomal deletions, paracentric and pericentric inversions.
    Unbalanced and balanced translocations, Robertsonian, chromosomal
    markers. Sub-microscopic deletions and duplications (Williams, di
    diGeorge, Cri du Chat, Smith Magenis, Wolf Hirschhorn)
    6. Mendelian genetic pathology
    Classes of point mutations, transition and transversion, conservative,
    missense, nonsense, nonstop. Insertions, deletions with frame-shift and
    non-duplications, gene conversion. Pathological signification of the
    various classes of DNA variations: equivalent alleles, amorphous,
    hypomorphic, hypermorphic, neomorph and antimorph. International
    nomenclature of genetic variations
    7. Mendelian monoallel disorders with de novo mutations
    (ex: craniosynostosis, achondroplasia, Noonan syndrome, Rubinstein-Taybi syndrome, etc.).
    8. Mendelian monoallellic diseases with autosomal dominant transmission
    (eg neurofibromatosis, S. Marfan, polycystic kidney, osteogenesis
    imperfecta).
    9. Mendelian monoallelic X-linked disorders
    (Duchenne and Becker muscular dystrophies, hemophilia, Rett
    syndrome).
    10. Mendelian diseases with autosomal recessive transmission
    (cystic fibrosis, alpha and beta thalassemia, spinal muscula atrophy,
    hemochromatosis, glycogen storage disorders, limb-girdle muscular dystrophies)
    11. Dynamic mutations
    Dynamic mutations in non-coding regions (fragile X, myotonic dystrophy).
    Dynamic mutations in coding regions (Huntington's chorea, spinocerebellar
    ataxias)
    12. Mutations in chromosomal regions with imprinting
    (Prader-Willi, Beckwith Wiedemann, Angelman, Silver-Russel).
    13. Mitochondrial DNA mutations
    (MERFF, MELAS, LHON, KS, S. Leigh)
    14. Multi-factorial characters and GWAs studies

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