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    Filomena DE NIGRIS

    Insegnamento di METODOLOGIE MOLECOLARI IN PATOLOGIA CLINICA

    Corso di laurea in TECNICHE DI LABORATORIO BIOMEDICO (ABILITANTE ALLA PROFESSIONE SANITARIA DI TECNICO DI LABORATORIO BIOMEDICO)

    SSD: MED/05

    CFU: 1,00

    ORE PER UNITÀ DIDATTICA: 10,00

    Periodo di Erogazione: Primo Semestre

    Italiano

    Lingua insegnamento

    ITALIANO

    Contenuti

    Concetti e conoscenze di base delle principali tecniche molecolari in uso in diagnostica nei laboratori di Patologia clinica

    Testi di riferimento

    M. Cioffi “Manuale di diagnostica di laboratorio” Minerva medica
    T. Strachan A.P. Read. “Genetica umana molecolare” UTET

    Obiettivi formativi

    Il corso ha l’obiettivo di consentire allo studente di conoscere le principali tecniche molecolari utilizzate per la determinazione di mutazioni e polimorfismi noti coinvolti in varie patologie, per screening mutazionali, nella diagnosi di microrganismi e nella diagnosi della resistenza ai farmaci

    Prerequisiti

    - Fondamenti di fisica e chimica generale
    - Fondamenti di biologia e biochimica
    - Fondamenti di fisiologia
    - Fondamenti di microbiologia

    Metodi didattici

    Lezioni frontali e lavoro interattivo con gli studenti. Saranno condivisi con gli studenti file pdf delle diapositive delle lezioni. Queste sono da considerarsi un supporto allo studio sui libri di testo. Sono previste, durante e dopo l'erogazione dell'insegnamento, attività di tutorato che lo studente potrà concordare con il docente.

    Modalità di verifica dell'apprendimento

    L’esame si svolge contestualmente alla valutazione degli insegnamenti del C.I. La verifica è finalizzata ad accertare il conseguimento degli obiettivi formativi, in coerenza dei risultati di apprendimento attesi e con i descrittori di Dublino. Il voto finale, espresso in trentesimi, riflette il livello complessivo di padronanza dei contenuti: da eccellente (30 e lode) a sufficiente (18/30). Il voto finale è espresso collegialmente dalla Commissione d’esame che, tenendo conto del livello di apprendimento dimostrato nei diversi ambiti disciplinari e delpeso di ciascun insegnamento, formula un giudizio unitario riferito all’intero Corso Integrato. La prova si considera superata con un punteggio minimo di 18/30, corrispondente al possesso delle conoscenze e delle competenze di base previste, nonché alla loro applicazione a semplici contesti della pratica assistenziale.

    Altre informazioni

    Per chiarimenti e problematiche inerenti agli argomenti dell’ insegnamento gli studenti possono rivolgersi al docente di riferimento secondo le modalità di ricevimento indicate nella pagina web

    Programma esteso

    1. Estrazione, precipitazione, separazione analitica e dosaggio degli acidi nucleici

    2. PCR (Polymerase Chain Reaction). Amplificazione nested. Multiplex PCR

    3. RT-PCR (Reverse Transcription-PCR)

    4. Real-time PCR

    5. Strategie per la determinazione di mutazioni e polimorfismi:
    PCR-CTPP (PCR-Confronting Two Pair Primers)
    PCR-ARMS (PCR-Amplification Refractory Mutation System)
    PCR-reverse dot-blot
    Enzimi di restrizione e loro applicazione nella diagnosi di mutazioni, PCR-RFLP (PCR- restriction fragment length polymorphism)

    6. La PCR nella diagnostica microbiologica

    7. Determinazione della sequenza di un acido nucleico mediante Sequenziamento automatico diretto (Metodo di Sanger)

    8. Next Generation Sequencing (NGS)

    9. Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) per analisi di riarrangiamenti

    English

    Teaching language

    Italian

    Contents

    Basic concepts and knowledge of the main molecular techniques used in diagnostics in Clinical Pathology laboratories

    Textbook and course materials

    T. Strachan A.P. Read. “Genetica umana molecolare” UTET English version

    Course objectives

    The course aims to enable students to become familiar with the main molecular techniques used for the identification of known mutations and polymorphisms involved in various diseases, for mutational screening, in the diagnosis of microorganisms, and in the diagnosis of drug resistance.

    Prerequisites

    Fundamentals of Physics and General Chemistry

    Fundamentals of Biology and Biochemistry


    Fundamentals of Physiology


    Fundamentals of Microbiology

    Teaching methods

    TFrontal and interactive lessons with students. PDF files of the lecture slides will be shared with the students. These should be regarded as a study aid to complement the textbooks. Tutoring activities will be available during and after the delivery of the course, and students may arrange them with the instructor.

    Assessment methods

    The examination is conducted simultaneously with the assessment of the courses included in the Integrated Course (I.C.). The assessment is intended to verify the achievement of the educational objectives, in accordance with the expected learning outcomes and the Dublin Descriptors. The final grade, expressed on a scale of 30, reflects the overall level of mastery of the course content, ranging from excellent (30 with honors) to satisfactory (18/30). The final grade is determined collectively by the Examination Committee, which, taking into account the level of learning demonstrated across the different disciplinary areas and the weight of each course, formulates a single overall evaluation for the entire Integrated Course. The examination is considered passed with a minimum score of 18/30, corresponding to the acquisition of the required basic knowledge and competencies, as well as their application to simple contexts of clinical nursing practice.

    Other information

    or clarifications and issues related to the course topics, students may contact the lecturer in charge according to the office hours and procedures indicated on the webpage.

    Detailed syllabus

    ranslation into English:

    Extraction, precipitation, analytical separation, and quantification of nucleic acids

    PCR (Polymerase Chain Reaction). Nested amplification. Multiplex PCR

    RT-PCR (Reverse Transcription PCR)

    Real-time PCR

    Strategies for the determination of mutations and polymorphisms:

    PCR-CTPP (PCR–Confronting Two-Pair Primers)

    PCR-ARMS (PCR–Amplification Refractory Mutation System)

    PCR reverse dot-blot

    Restriction enzymes and their application in mutation diagnosis, PCR-RFLP (PCR–Restriction Fragment Length Polymorphism)

    PCR in microbiological diagnostics

    Determination of nucleic acid sequence by direct automated sequencing (Sanger method)

    Next Generation Sequencing (NGS)

    Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) for the analysis of genomic rearrangements

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